A harmadik projekt is elindult az MTA Cloudon az új koronavírus (SARS-COV-2) okozta járvány (COVID-19) elleni küzdelem támogatására. A Pécsi Tudományegyetem Szentágothai Kutatóközpont kutatói a járvány kezdete óta vizsgálják a vírus genetikai változásait. Ezen adatok megfelelő számítási kapacitással és algoritmussal történő elemzése a vírusok evolúciós, tér-időbeli terjedési kapcsolatait képes feltárni. A járvány kezdetének ilyen irányú vizsgálata választ ad a hazai terjedés dinamizmusára és jellemzőire. A hazai járvány tekintetében egyelőre nem készült ilyen elemzés.
Tehát a hagyományos diagnosztikai adatokon túl ez az eljárás választ tud adni:
- a vírus hazai tér-időbeliségére
- a vírus országba történő megjelenésének forrására
- az országon belüli terjedés irányára és mértékére
- bizonyos genetikai változások dominanciájára és terjedésére
Az MTA Cloud használatával és a SZTAKI kutatóinak támogatásával 50-szeresére gyorsult az alkalmazott algoritmus végrehajtása.
Projektvezető: Dr. Kemenesi Gábor
Szentágothai János Kutatóközpont
Dátum: 2020. 04. 22.